Przeciwciała przeciwko protrombinie 3 jak sama nazwa wskazuje są skierowane przeciwko nieaktywnemu białku - protrombinie, która w kaskadzie krzepnięcia przechodzi w aktywną trombinę.Przeciwciała należą do większej grupy przeciwciał antyfosfolipidowych, które oznaczamy przy niepowodzeniach zajścia w ciążę czy nawykowych poronieniach.