Antygen HLA-B27 jest badaniem pomocniczym przy diagnozowaniu choób o podłożu autoimmunologicznym takich jak :
- ZZSK: zesztywniające zapalenie stawów kręgosłupa
- zespół Reitera
- młodzieńcze reumatoidalne zapalenie stawów
Badanie jest polecane przy wystepowaniu ostrych i przewlekłych bolów kręgosłupa, klatki piersiowej, stawów czy oczu.